O Canil atua em diversas missões que são executadas com a utilização dos cães, existem três classificações de emprego: cães de faro, cão de choque e cão de patrulha, o cão patrulha é utilizado em Operações como jogos de futebol, passeatas, apresentações em eventos públicos e principalmente no policiamento ostensivo. O cão de choque já tem um treinamento para atuar em tumultos, casas prisionais e rebeliões. Os cães de faro têm a sua própria característica de combate ao crime narcotráfico onde precisa encontrar o material ilícito e busca de elementos foragidos ou perdidos em matas.
O canil do 4° BPM também presta apoio aos órgãos de Segurança Pública, Polícia Civil, Polícia Federal, Receita Federal, Polícia Rodoviária Federal e Forças Armadas.